Les dejo la segunda y última parte de los artículos elegidos en esta sección del ECCMID 2023 por Ana Gales de Brasil y luego les dejare una selección de los elegidos por el otro presentador de Year in Clinical Microbiology.
7- Hamilton F et al. Time to positivity in bloodstream infection is not a prognostic marker for mortality: analysis of a prospective multicentre randomized control trial. Clinical Microbiology and Infection, 2022; 28: 136.e7-136.e13,
https://doi.org/10.1016/j.cmi.2021.05.043. Aquí el tiempo hasta la positividad, al incubar las botellas en equipos automatizados de hemocultivos, no estuvo asociado con la mortalidad, excepto en Candida spp (tiempos más largos asociados con peores resultados), y Streptococcus pneumoniae (tiempos más cortos asociados con peores resultados). Hubo una gran variación entre los tiempos medios de los distintos centros, lo que limita la validez externa.Yo me pregunto si el volumen de sangre inoculado en cada botella influye sobre los tiempos de positividad o el tiempo entre la extracción y la incubación en el equipo automatizado. Nosotros hemos hecho un trabajo sobre la relación del tiempo de positividad y la contaminación. Ya les contaré cuando esté publicado
8- Este es un trabajo que quiero hacer en mi Lab de #microclin.
.
El objetivo de este estudio fue evaluar la precisión y solidez del EUCAST RAST (test rápido de susceptibilidad antimicrobiana) https://www.eucast.org/rapid_ast_in_bloodcultures
totalmente automatizado directamente a partir de un hemocultivo positivo y apreciar sus limitaciones de aplicación.
Este estudio se llevó a cabo en dos fases: (i) frascos de hemocultivos (BC) enriquecidos con 779 aislados clínicos no duplicados y (ii) un ensayo clínico prospectivo que incluyó 534 BC positivos procesados secuencialmente de forma rutinaria en el Laboratorio de Bacteriología de los Hospitales Universitarios de Ginebra. Los resultados del RAST se compararon con los de la prueba de difusión en disco estandarizada EUCAST. Su primer hallazgo fue que los resultados de los hemocultivos enriquecidos predijeron con precisión los resultados que luego tendrían en el ensayo clínico. Los acuerdos categóricos globales para todas las especies analizadas fueron superiores al 95% . Sin embargo, el RAST para Pseudomonas aeruginosa planteó varios retos. La concordancia categórica para imipenem fue inferior al 95% a las 6 h y no mejoró con tiempos de incubación más largos. Además, piperacilina-tazobactam, ceftazidima y cefepima no pueden liberarse a las 6 h debido a rendimientos subóptimos, pero la concordancia categórica mejoró sustancialmente a las 8 h. Los resultados establecen que el rendimiento del EUCAST RAST totalmente automatizado directamente a partir de frascos de hemocultivos positivos es consistentemente robusto, incluso para la detección de β-lactamasas de espectro extendido (BLEE), bacterias productoras de carbapenemasas y Staphylococcus aureus resistente a la meticilina (MRSA). La automatización mejoró notablemente el porcentaje de zonas de inhibición legibles y redujo el porcentaje de aislados categorizados en el área de incertidumbre técnica (ATU). En resumen, un EUCAST RAST totalmente automatizado puede mejorar sustancialmente el flujo de trabajo del laboratorio al reducir el tiempo de intervención y eliminar las fuertes limitaciones vinculadas a las lecturas manuales en momentos definidos con precisión.
9-Ahora viene un estudio que es similar al anterior pero que se realizó manualmente. Más para nuestros laboratorios latinoaméricanos.
Muhammet Rıdvan Tayşi, Gönül Çiçek Şentürk, Elif Çalişkan, Duygu Öcal, Gülşah Miroglu, İrfan Şencan, Implementation of the EUCAST rapid antimicrobial susceptibility test (RAST) directly from positive blood culture bottles without the advanced identification systems, Journal of Antimicrobial Chemotherapy, Volume 77, Issue 4, April 2022, Pages 1020–1026, https://doi.org/10.1093/jac/dkac003
EUCAST publicó sus recomendaciones para la realización de pruebas rápidas de susceptibilidad antimicrobiana (RAST) directamente a partir de frascos de hemocultivos (HC) de señal positiva. El objetivo del presente estudio fue investigar la exactitud y aplicabilidad del método RAST predicho (p-RAST) sin utilizar sistemas de identificación automatizados previos, y los efectos de los resultados obtenidos con este método en la decisión de tratamiento del clínico. Recordemos que EUCAST tiene resultados RAST solo para determinadas especies. En este caso, al no identificar previamente, se incluyeron todas las especies.
Se hicieron lecturas a las 4, 6 y 8 h de incubación y se compararon con los resultados obtenidos con los métodos convencionales de difusión en disco.
Se incluyeron 145 aislados, de los cuales 34 (22 CoNS, 3 Enterobacter aerogenes, 3 Enterobacter cloacae, 4 Serratia marcescens, 1 Proteus mirabilis y 1 Raoultella ornithinolytica) no tenían puntos de corte en EUCAST RAST y 111 aislados tenían puntos de corte en EUCAST RAST.
En la tabla de arriba se puede ver la tasa de errores encontrada. Con los resultados de p-RAST (n=145) , se realizó un escalado efectivo en el tratamiento antimicrobiano en 45 pacientes, y se pudo haber realizarzo un desescalado efectivo en 32 pacientes, pero se recomendó no realizar desescalado en el curso del estudio. Se concluye que incluso en un laboratorio de microbiología con instalaciones limitadas, se pueden obtener resultados fiables de las pruebas de susceptibilidad antimicrobiana rápidas con el método p-RAST sin utilizar sistemas automatizados y se puede orientar la elección del antimicrobiano en menos tiempo. Esto es interesante, especialmente pensando que CLSI también tiene una metodología para la realización de estudios de susceptibilidad rápidos a partir de hemocultivos por disco difusión.
10- Este trabajo es algo que nosotros hacemos permanentemente, para inocular el sistema automatizado Vitek, sin habernos puesto a pensar que podría haber diferencias de acuerdo al tiempo de crecimiento. En este caso se hizo disco difusión desde crecimientos de pocas horas.
Webber DM, Wallace MA, Burnham CD. Stop Waiting for Tomorrow: Disk Diffusion Performed on Early Growth Is an Accurate Method for Antimicrobial Susceptibility Testing with Reduced Turnaround Time. J Clin Microbiol. 2022 May 18;60(5):e0300720. doi: 10.1128/JCM.03007-20.
El objetivo fue mejorar el tiempo de respuesta reduciendo el tiempo de incubación de los cultivos antes de realizar la susceptibilidad por difusión en disco. Para el desarrollo inicial del método, se inocularon cepas clínicas aisladas (n = 13) y cepas de control de calidad (n = 8) de bacterias en agar sangre y se incubaron a 35°C durante 6, 10 o 24 h antes de realizar la prueba de difusión en disco, por triplicado, utilizando un panel de agentes antimicrobianos clínicamente apropiados. Los tamaños de las zonas de difusión en disco se interpretaron siguiendo las directrices del Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). En comparación con las 24 h de incubación estándar, el crecimiento temprano a las 6 h presentó un 1,3% de errores importantes (ME) y un 1,9% de errores muy importantes (VME), mientras que el crecimiento a las 10 h produjo un 0,7% de ME y ningún VME. La concordancia categórica con la incubación estándar fue similar tanto para el crecimiento de 6 h (96,7%) como para el de 10 h (96,7%).
Basados en estos resultados, se realizó disco difusión en condiciones optimizadas (crecimiento de 6 h), utilizando 100 aislados clínicos adicionales, demostrando un alto nivel de concordancia categórica (917 de 950 mediciones [96,5%] ), así como ausencia de VME o ME.
Se concluye que el uso del crecimiento temprano para la prueba de disco difusión es un método sencillo y preciso para las pruebas de susceptibilidad que puede reducir el tiempo de obtención de resultados hasta en 18 h, en comparación con la incubación estándar, sin costes adicionales de suministros o equipos/instrumentación. Pero claro, requiere laboratorios que trabajen 24/7 para que esto tenga impacto en el manejo clínico del paciente.
Ana Gales nombró otros trabajos que incluyeron el uso de técnicas de metagenómica en el diagnóstico microbiológico. Muy interesantes trabajos, quizá lejos de nuestra practica actual.
Voy a realizar una selección de los trabajos que presentó en esta sección el microbiólogo clínico Sypros Pournaras de la Universidad de Atenas en Grecia.
11- Uno de los trabajos que presentó fue:
Tutone M, Bjerklund Johansen TE, Cai T, Mushtaq S, Livermore DM. SUsceptibility and Resistance to Fosfomycin and other antimicrobial agents among pathogens causing lower urinary tract infections: findings of the SURF study. Int J Antimicrob Agents. 2022 May;59(5):106574. doi: 10.1016/j.ijantimicag.2022.106574.
Este trabajo muestra que fosfomicina y nitrofurantoína continuan siendo opciones terapeuticas interesantes y activas para ITU.
12- El trabajo siguiente muestra un paciente de 52 años con infección respiratoria causada por Acinetobacter baumannii multiresistente que fue tratado con distintos antibióticos intravenosos más bacteriofagos por la vía inhalatoria. A pesar del creciente reporte del uso de fagos como terapia antimicrobiana, siguen habiendo detalles que impiden su uso más generalizado. Les dejo el link al artículo, por supuesto.
Rao S, Betancourt-Garcia M, Kare-Opaneye YO, Swierczewski BE, Bennett JW, Horne B, Fackler J, Suazo Hernandez LP, Brownstein MJ. Critically Ill Patient with Multidrug-Resistant Acinetobacter baumannii Respiratory Infection Successfully Treated with Intravenous and Nebulized Bacteriophage Therapy. Antimicrob Agents Chemother. 2022 Jan 18;66(1):e0082421. doi: 10.1128/AAC.00824-21.
13- El articulo siguiente analizado trae la actividad de un nuevo antibiótico que esta entrando a FDA para su aprobación: sulbactam-durlobactam.
Karlowsky JA, Hackel MA, McLeod SM, Miller AA. In Vitro Activity of Sulbactam-Durlobactam against Global Isolates of Acinetobacter baumannii-calcoaceticus Complex Collected from 2016 to 2021. Antimicrob Agents Chemother. 2022 Sep 20;66(9):e0078122. doi: 10.1128/aac.00781-22.
En este estudio se analizaron 5032 aislamientos de A.baumannii (ABC) de distintas partes del mundo. Con el punto de corte de susceptibilidad de 4 μg/mL, sulbactam-durlobactam inhibió el 98,3% de todos los aislados ABC y >96% de los aislados no susceptibles a sulbactam, imipenem, ciprofloxacina, amikacina y minociclina, así como los resistentes a colistin, multidogro y extremo drogo resistentes. Por supuesto, que de aprobarse será una opción que estamos necesitando para las infecciones por ABC. Y ya me gustó para hacer una reseña del mismos en @microclinuy
14- El cefiderocol (FDC) y la ceftazidima-avibactam (CZA) forman parte de la última generación de antibióticos comercializados contra los Gram negativos resistentes a los carbapenemas y sin embargo ….. la resistencia contra los mismos ya esta aquí como lo demuestra este otro artículo que se analizó:
Poirel L, Sadek M, Kusaksizoglu A, Nordmann P. Co-resistance to ceftazidime-avibactam and cefiderocol in clinical isolates producing KPC variants. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2022 Apr;41(4):677-680. doi: 10.1007/s10096-021-04397-x.
15- Y en el siguiente artículo la cosa se complicó y es la razón por la cual yo afirmó que la microbiología clínica es cada vez más compleja y es más dificil seguirle el paso. Pero eso intento….je je je
En este artículo que sigue, aislados de K. pneumoniae productores de KPC, con CIMs a CAZ/AVI aumentadas (8 a 32 mg/L) y susceptibilidad a carbapenem (CIM de imipenem y meropenem, <1 mg/L) se recuperaron entre 6 y 24 días después del tratamiento con CAZ/AVI. Si, escuchaste bien…productores de KPC, sensibles a carbapenems.
La secuenciación de genoma completo confirmó que todos estos aislados de K. pneumoniae pertenecían al secuenciotipo de alto riesgo 307 (ST307). La presencia de los nuevos genes blaKPC-46, blaKPC-66 y blaKPC-92 se confirmó en los aislados de K. pneumoniae con CIMs CAZ/AVI elevadas y actividad a carbapenem restaurada.
Y como se imaginaran estas cepas productoras de KPC pero sensibles a carbapenems no son sospechadas ni detectadas por los métodos fenotípicos, excepto por los inmunocromatográficos. Fueron si detectadas por el método molecular XpertCARBA. Y acá abajo les dejo el link al trabajo.
Hernández-García M, Castillo-Polo JA, Cordero DG, Pérez-Viso B, García-Castillo M, Saez de la Fuente J, Morosini MI, Cantón R, Ruiz-Garbajosa P. Impact of Ceftazidime-Avibactam Treatment in the Emergence of Novel KPC Variants in the ST307-Klebsiella pneumoniae High-Risk Clone and Consequences for Their Routine Detection. J Clin Microbiol. 2022 Mar 16;60(3):e0224521. doi: 10.1128/jcm.02245-21.
16- Este presentador trajo innumerables artículos y si continuo los voy a aburrir.
Pero para terminar les quiero dejar un articulo interesante sobre una nuevo test comercial para realizar susceptibilidad antibiótica directo desde el caldo de la botella de hemocutlivos positivo, por medio de determinación de CIM.
En ECCMID de 2022, al lado del enorme stand de BioMerieux, había uno pequeño de una empresa desconocida para mi: Specific.
Y me contaron “BioMerieux esta a punto de comprar esta empresa”. En ECCMID 2023 el método Specific Reveal ya estaba en el stand de BioMerieux. En este Year in Clinical Microbiology se presentó: Tibbetts R, George S, Burwell R, Rajeev L, Rhodes PA, Singh P, Samuel L. Performance of the Reveal Rapid Antibiotic Susceptibility Testing System on Gram-Negative Blood Cultures at a Large Urban Hospital. J Clin Microbiol. 2022 Jun 15;60(6):e0009822. doi: 10.1128/jcm.00098-22.
Los autores evaluaron el sistema rápido Specific Reveal (Specific Diagnostics, San Jose, CA) en hemocultivos positivos con organismos Gram-negativos en un gran hospital urbano para evaluar su potencial para el uso clínico rutinario.
Ciento cuatro hemocultivos positivos fueron seleccionados al azar, se tiñeron con Gram, se diluyeron 1:1.000 en agua Pluronic, se inocularon en placas antibióticas de 96 pocillos, se sellaron con el panel sensor Reveal y se colocaron en el instrumento Reveal para su incubación y lectura. Se determinó la CIM y la categoría susceptible/intermedia/resistente y se comparó con los resultados de Vitek 2 para los 17 antimicrobianos disponibles y con Sensititre (Thermo Fisher) para 24 antimicrobianos. Reveal obtuvo un 98,0% de concordancia esencial (EA) y un 96,3% de concordancia categórica (CA) con Sensititre, con sólo un 1,3% de error muy grave (VME) y un 97,0%/96,2%/1,3% EA/CA/VME frente a Vitek 2. El tiempo medio hasta la obtención de resultados (TTR) para Reveal fue de 4,6 h. La preparación de las muestras fue relativamente poco laboriosa y tuvo una duración media de 3 min. Los autores concluyen que el sistema Reveal permite realizar pruebas de susceptibilidad precisas y rápidas de hemocultivos con bacterias Gram negativas.
Espero este pantallazo les haya sido de utilidad. Y les despierte el deseo de ir a leer algunos de estos artículos en forma completa.
Seguimos en contacto, fan de la #microclin. Hasta el próximo artículo del blog de MicroClinUy.
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