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ECCMID 2023 Year in Clinical Microbiology- primera parte


En el European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ECCMID), todos los años se hace este simposio donde se presentan las principales publicaciones en el área de microbiología del año anterior. Este año el ECCMID fue en Copenhague, Dinamarca y mira que linda postal te dejo de uno de los lugares más emblemáticos de la ciudad: Nyhavn.


Ana Cristina Gales, Profesora de la División de Enfermedades Infecciosas de la Escola Paulista de Medicina, Universidade Federal de São Paulo (EPM-UNIFESP), y Directora del "Laboratory Alerta" en la misma institución fue una de las encargadas de presentar este simposio.


1-El primer artículo que llamó su atención fue el descubrimiento de una bacteria que mide hasta 1 centímetro y que rompe el paradigma que las bacterias son seres vivos microscópicos. Este hallazgo, también, fue seleccionado por varios journals como una de los descubrimientos más importantes del 2022. Es una bacteria que tiene un habitat ambiental y yo también le hubiera puesto: magnifica



2- Luego, Ana eligió dos artículos de la edición de enero de 2023 del Journal of Clinical Microbiology (JCM). Uno de ellos es una revisión de los cambios taxonómicos.



Y el otro articulo en la misma edición es un debate sobre cómo efectivizar los cambios taxonómicos "Punto-contrapunto: ¿Qué hay en un nombre? Los laboratorios de microbiología clínica deben utilizar una nomenclatura basada en la taxonomía actual"

Nathan A. Ledeboer, el editor de esta sección del JCM concluyó los Puntos de Acuerdo:

1. Los laboratorios clínicos se enfrentan al importante reto de comunicar los cambios en la taxonomía de forma clara y transparente para reflejar tanto el nombre actualizado como el anterior durante un periodo de tiempo.

2. Los cambios taxonómicos pueden resultar confusos para microbiólogos y clínicos, lo que puede conducir a un tratamiento antimicrobiano erróneo.

3. Se necesitan urgentemente mejores medios de comunicación de los cambios taxonómicos entre los laboratorios clínicos y los médicos.

Cuestiones por resolver

1.Los cambios en la taxonomía publicados por el Int J Syst Evol Microbiol deben cambiarse inmediatamente y no cuestionarse.

2. Es necesario un árbitro de los cambios taxonómicos entre la comunidad clínica y los cambios incluidos en Int J Syst Evol Microbiol o en la lista de validación de Int J Syst Evol Microbiol.

Y cuales son estos cambios ? Son muchos. Puedes chequear el articulo para verlos. https://journals.asm.org/doi/epub/10.1128/jcm.00282-22



3- El siguiente artículo es uno de los que se van a transformar en el más citado en la comunidad microbiológica/infectológica ya que pone en cifras el problema de la resistencia antimicrobiana. Si aún no lo conoces , te invito a que vayas a verlo y revises las tablas que trae.

Antimicrobial Resistance Collaborators. Global burden of bacterial antimicrobial resistance in 2019: a systematic analysis. Lancet. 2022 Feb 12;399(10325):629-655. doi: 10.1016/S0140-6736(21)02724-0. Epub 2022 Jan 19. Erratum in: Lancet. 2022 Oct 1;400(10358):1102.

4- El siguiente artículo que llamó la atención de Ana fue Háhn J et al. Glyphosate and glyphosate-based herbicides (GBHs) induce phenotypic imipenem resistance in Pseudomonas aeruginosa. Sci Rep12, 18258 (2022). https://doi.org/10.1038/s41598-022-23117-9 . El mismo muestra como el glifosato, un herbicida muy utilizado en la agricultura induce resistencia a imipenem en P.aeruginosa.


5- Barraud O et al. Integrons, a predictive biomarker for antibiotic resistance in acute sepsis: the IRIS study, Journal of Antimicrobial Chemotherapy, Volume 77, Issue 1, January 2022, Pages 213–217, https://doi.org/10.1093/jac/dkab348 Muy interesante, este artículo concluye que la ausencia de intI1 e intI2 en muestras biológicas de pacientes con infecciones relacionadas con bacilos Gram negativos es predictiva de la ausencia de resistencias adquiridas. Esta ausencia tiene un alto valor predictivo negativo. Por supuesto, por estos lares estamos lejos de aplicar estas técnicas en nuestros laboratorios de #microclin.


6- El siguiente artículo seleccionado trae un tema que me tiene muy interesada. Se trata del "Diagnostic Stewardship" o uso racional de estudios de laboratorio. Woods-Hill CZ et al. Association of Diagnostic Stewardship for Blood Cultures in Critically Ill Children With Culture Rates, Antibiotic Use, and Patient Outcomes: Results of the Bright STAR Collaborative. JAMA Pediatr. 2022 Jul 1;176(7):690-698. doi:10.1001/jamapediatrics.2022.1024. Aquí se trabajo para disminuir la indicación de hemocultivos y de esta manera se disminuyó el uso de antibióticos. Tal como dice Ana, si se indica hemocultivos, se inicia tratamiento antibiótico. Acá se logra disminuir el uso de antibióticos sin impacto sobre el outcome de los pacientes.


Estos son los primeros seis artículos seleccionados. En una siguiente entrada de mi blog te voy a dejar los siguientes que tratan sobre diagnóstico rápido. Hasta pronto, fan de la #microclin.










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